Mongolijos upės kyla aukštai kalnuose. Ir dauguma jų yra didžiausių Sibiro ir Tolimųjų Rytų upių aukštupiai.
Zheltura upė
Upės vaga eina per Buriatijos (Rusija) ir Mongolijos teritoriją. Želtura yra dešinysis Dzhida upės intakas. Upės šaltinis yra Mongolijos žemėse. Bendras upės kanalo ilgis yra 202 kilometrai, ir beveik visi jie eina per šalies teritoriją. Rusija teka tik 18 kilometrų upių.
Lietus upė gauna didžiąją dalį vandens. Didelis vanduo būna vasarą, kai Mongolijoje iškrenta daug kritulių. Prie upės žiočių yra Želtura ir Tengereko (Buriatijos) kaimai. Upės vanduo aktyviai naudojamas kaip geriamojo vandens šaltinis.
Menzos upė
Vietiniai gyventojai upę vadina Minzhiin-Gol. Geografiškai kanalas eina per Mongoliją ir Rusiją, būdamas kairysis Čiko upės intakas. „Menza“šaltinis yra Baga-Khentai kalnagūbris (Mongolija). Nusileidęs nuo kalnų, jis eina per Trans-Baikalo teritoriją ir vėl grįžta iš Mongolijos. Bendras upės kanalo ilgis yra 337 kilometrai.
Apie lapkričio antrąją pusę upė padengta ledu. Ledo laužymas prasideda balandžio pabaigoje. Bendra užšalimo trukmė yra nuo 145 iki 180 dienų. Žiemą upė užšąla per 130 centimetrų. Upėje gyvena: lenokas, taimenas, ešerys, burbotas, pilkasis ir šamas.
Orchono upė
Upės vaga visiškai eina per Mongolijos teritoriją ir yra 1124 kilometrų ilgio. Orkhon yra antra pagal ilgį upė Mongolijoje.
Upės šaltinis yra Khangai kalnuose. Upės aukštupis eina siauru į kanjoną panašiu slėniu. Viršutinė Orkhon upė sudaro gana aukštą (20 metrų) ir platų (10 metrų) krioklį. Vidurinė upės dalis eina per gilų vingiuotą slėnį ir tik išplaukusi iš kalnų upė išsiplečia iki 150 metrų. Orkhonas nuo lapkričio iki balandžio yra padengtas ledu.
Upės slėnyje yra daug įdomių lankytinų vietų: Khara -Balgas - senovinis miestas, buvęs Uigūrų valstijos sostinė; Karakorumas yra pagrindinis Mongolų imperijos miestas. Be to, upės slėnyje buvo rasta keletas hunų laidojimo kapų.
Egiin-Gol upė
Upė teka per Mongolijos teritoriją. Bendras jo ilgis yra 475 kilometrai. Upės šaltinis yra Khubsugul ežero vandenys. Tada Egiin-Gol lėtai nuneša savo vandenis į tolimąją Selengą. Maždaug nuo spalio iki balandžio pabaigos upė yra padengta ledu ir tampa patrauklia vieta žiemos žvejybos mėgėjams. Čia randama - pilkasis, lenokas, taimenas. Viduryje upė suskyla į daugybę šakų.
