Ufos istorija prasideda penktajame amžiuje. Tikėtina, kad šiuolaikinės Ufos teritorijoje tuo metu buvo viduramžių gyvenvietė. Tarp didžiausių Aukso ordos miestų išskirtinis XIV amžiaus arabų autorius Ibn Khaldun, vadinamas Baškirų miestu (Bashgird). Dabar, atlikdami lyginamąją senovės žemėlapių ir žymėjimų analizę, istorikai daro išvadą, kad būtent minėto senojo miesto vietoje yra Ufos stendai.
Oficialus miesto statusas
XVI amžiuje dabartinės Ufos teritorijoje buvo įsikūrusi Nogai ordos gubernatoriaus Tura Khano žiemos būstinė. Kai dalis Baškirijos įžengė į Maskvos karalystę (1557 m.), Vietiniai gyventojai kreipėsi į Ivaną IV su pasiūlymu savo žemėse pastatyti miestą.
XVI amžiuje (1574 m.) Prie Sutoloko upės buvo pastatyta tvirtovė, tai yra tvirtovė, ir ta vieta pradėta vadinti Ufos rajonu, o Ufa tapo jos centru. Ufos kalėjimas buvo pastatytas vadovaujant Ivanui Nagyui. Vėliau iš sostinės išsiųstas Michailas Nagojus buvo pirmasis rajono vaivada, jis vadovavo Ufos raštinės trobei (jam vadovavo du šimtai lankininkų).
Pastačius miesto sienas, tvirtovė tapo žinoma kaip Kremlius. Kaip papildoma apsauga, aplink jį buvo pastatyta tvora iš tvirtų rąstų, tvirtai prigludusių vienas prie kito, o dviejose priešingose konstrukcijos pusėse, šiaurinėje ir pietinėje dalyse, buvo pastatytas ąžuolinis bokštas.
XVIII amžiuje miestą paveikė valstiečių karas, sukilimas buvo numalšintas. Po to Ufa susijungė su Kazanės provincija, kiek vėliau - su Orenburgo provincija. Pradžioje vietos valdžia užsiėmė miestų planavimu. Architektas V. Geste nupiešė išplėstų miesto gatvių planą. Bolšijos Kazanskaja gatvė buvo atgabenta į būsimą Gostiny Dvor ir Verkhne-Torgovaya aikštę.
XX amžius
1922 metų liepą visos Rusijos centrinio vykdomojo komiteto sprendimu Ufos provincija buvo panaikinta. Praėjusio amžiaus 20-30-aisiais miestas pradėjo sparčiai vystytis. Bendroji pramonės produkcija išaugo 16 kartų. Didžiojo Tėvynės karo metu į Ufą buvo evakuotos kelios dešimtys pramonės įmonių. Čia taip pat buvo evakuoti keli tyrimų institutai.
Po karo padidėjus naftos gavybai, Ufoje buvo pastatytos didelės naftos perdirbimo gamyklos, aktyviai vystėsi mašinų gamyba ir chemijos pramonė.
